Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms