Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1aQ921W0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms