Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms