Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atpaf2Q91YY4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms