Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms