Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Klc3Q91W40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klc3Q91W40 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms