Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms