Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf4Q8VI88 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms