Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhbdd2Q8VEK2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms