Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paip1Q8VE62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms