Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc36Q8VBW8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc36Q8VBW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms