Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim29Q8R2Q0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms