Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf183Q8QZS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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