Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vrk3Q8K3G5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Vrk3Q8K3G5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vrk3Q8K3G5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Vrk3Q8K3G5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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