Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms