Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms