Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brd3Q8K2F0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms