Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fcho1Q8K285 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcho1Q8K285 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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