Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Abcf3Q8K268 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Abcf3Q8K268 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Abcf3Q8K268 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf3Q8K268 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms