Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1eQ8K202 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms