Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfm1Q8K0D5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfm1Q8K0D5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms