Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne5Q8JZW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms