Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SbsnQ8CIT9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbsnQ8CIT9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SbsnQ8CIT9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SbsnQ8CIT9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SbsnQ8CIT9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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