Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CopaQ8CIE6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopaQ8CIE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms