Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo4Q8CHQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo4Q8CHQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms