Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc43a2Q8CGA3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms