Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hpf1Q8CFE2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms