Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx8Q8CFD4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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