Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc87Q8CDL9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms