Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nhlrc3Q8CCH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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