Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhe22Q8C6A8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms