Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms