Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FarsaQ8C0C7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FarsaQ8C0C7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms