Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf18Q8BM39 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf18Q8BM39 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms