Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DseQ8BLI4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DseQ8BLI4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms