Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc5a7Q8BGY9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms