Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Vipas39Q8BGQ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vipas39Q8BGQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms