Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8BGC1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8BGC1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms