Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Limd2Q8BGB5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Limd2Q8BGB5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms