Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Katnb1Q8BG40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms