Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prima1Q810F0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms