Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Avl9Q80U56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms