Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dsg1bQ7TSF1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dsg1bQ7TSF1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms