Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek5Q7TSC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek5Q7TSC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek5Q7TSC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek5Q7TSC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek5Q7TSC3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek5Q7TSC3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms