Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp3Q7TNH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms