Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd1l2Q7TN88 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms