Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s3Q7TN05 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms