Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tmed3Q78IS1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tmed3Q78IS1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmed3Q78IS1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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