Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme8Q715T0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme8Q715T0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms