Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Syne1Q6ZWR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Syne1Q6ZWR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms